Boltz-1: バイオ分子相互作用モデリングにおけるオープンソース革命

MIT Jameel Clinicは、バイオ分子複合体の3D構造予測においてAlphaFold3レベルの精度を達成する画期的なオープンソースバイオ分子モデルである_Boltz-1_を発表しました。Boltz-1は構造生物学における重要な躍進を代表し、研究者や組織に前例のない高精度モデリングツールへのアクセスを提供します。

達成とベンチマーク

Boltz-1は厳密に評価され、その結果はGoogle DeepMindのAlphaFold3と同等の精度を示しています。CASP15のような確立されたデータセットに対するテストでは、Boltz-1はクローズドソースのAlphaFold3複製であるChai-1を上回りました。重要な指標は以下の通りです：

• LDDT-PLI精度： Boltz-1は65%を達成し、Chai-1の40%を上回りました。
• ドッキング品質（DockQ > 0.23）： Boltz-1は83%のスコアを獲得し、Chai-1の76%を超えました。

これらの結果は、Boltz-1がタンパク質-リガンドおよびタンパク質-タンパク質相互作用モデリングのような複雑なタスクにおいて信頼性のあるものであることを強調しています。

グローバルコラボレーションのためのオープンサイエンス

Boltz-1の特徴は、そのオープンソースのアクセスibilitです。MITライセンスの下で公開されたこのパッケージは、トレーニングデータ、モデルの重み、推論コードを含んでいます。財政的および技術的な障壁を排除することで、Boltz-1は最先端のバイオ分子モデリングへのアクセスを民主化します。

MITは、このツールを共同革新の触媒として考えており、次のような分野での研究を加速させることを期待しています：

• 薬物発見： リガンド結合予測の精度を向上させること。
• 構造生物学： タンパク質構造の理解を進めること。
• システム生物学： 複雑な分子ネットワークのモデリング。

チームの努力

この成果は、MITの多分野にわたるチームの貢献を反映しており、Genesis Therapeuticsや米国エネルギー省などの協力者によって支援されています。この取り組みは、NSF Expeditionsプログラム、DTRA DOMANE Threatsプログラム、Cancer Grand Challengesの下でのMATCHMAKERSプロジェクトからの資金提供をも受けています。

今後の展望

Boltz-1チームは継続的な改善にコミットしており、バイオ分子相互作用の複雑なモデリング能力を高めるためのさらなるアップグレード計画があります。これらの進展は、今後数ヶ月内に展開され、Boltz-1がバイオ分子モデリングの最前線に留まることを保証します。

今日Boltz-1を試してみてください

研究者は、GitHubリポジトリを通じてBoltz-1にアクセスするか、Slackでの会話に参加するか、技術報告書を読むことができます。

詳細については、公式発表を訪問してください： MIT Jameel ClinicのBoltz-1。