Boltz-1:生物分子互動建模的開源革命

November 20, 2024

MIT Jameel Clinic 發布了 Boltz-1,這是一個開創性的開源 生物分子模型,達到了AlphaFold3級別的準確性,能夠預測 生物分子複合體的三維結構。Boltz-1在結構生物學上代表了一個 重大的進步,為研究人員和組織提供前所未有的高精度建模工具。

成就與基準

Boltz-1經過嚴格評估,結果顯示其準確性可與Google DeepMind的 AlphaFold3相媲美。在與CASP15等已建立數據集的測試中, Boltz-1超越了如Chai-1這樣的競爭對手,該模型是封閉源代碼的 AlphaFold3複製品。關鍵指標包括:

  • LDDT-PLI準確性: Boltz-1達到65%,而Chai-1為40%。
  • 對接質量(DockQ > 0.23): Boltz-1得分83%,超過Chai-1的 76%。

這些結果突顯了Boltz-1在蛋白質-配體和蛋白質-蛋白質 互動建模等複雜任務中的可靠性。

促進全球合作的開放科學

Boltz-1的不同之處在於其開源可達性。根據MIT 許可證發布的包中包括訓練數據、模型權重和推斷代碼。 通過消除財務和技術障礙,Boltz-1使尖端的生物分子建模工具 進入大眾。

MIT將此工具視為協作創新的催化劑,加速在以下領域的研究:

  • 藥物發現: 增強配體結合預測的準確性。
  • 結構生物學: 推進對蛋白質結構的理解。
  • 系統生物學: 建模複雜的分子網絡。

團隊合作的成果

這一成就反映了MIT多學科團隊的貢獻,並得到了 Genesis Therapeutics和美國能源部等合作夥伴的支持。 該計劃還受益於NSF Expeditions計劃、DTRA DOMANE威脅 計劃以及Cancer Grand Challenges的MATCHMAKERS項目 的資助。

展望未來

Boltz-1團隊致力於持續改進,計劃進一步升級以增強 其在建模複雜生物分子互動方面的能力。預計這些提升 將在未來幾個月內推出,確保Boltz-1始終處於 生物分子建模的最前沿。

今天就試試Boltz-1

研究人員可以通過其 GitHub庫訪問Boltz-1, 參加討論會議 Slack, 或閱讀技術報告

欲了解更多詳情,請訪問官方公告: MIT Jameel Clinic的Boltz-1

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