Boltz-1: Biyomoleküler Etkileşim Modellemesinde Açık Kaynaklı Bir Devrim

MIT Jameel Klinik, biyomoleküler komplekslerin 3D yapılarını tahmin etmede AlphaFold3 seviyesinde doğruluk sağlayan, çığır açıcı bir açık kaynaklı biyomoleküler model olan Boltz-1'i tanıttı. Boltz-1, yapısal biyolojide önemli bir sıçrama olup, araştırmacılara ve kuruluşlara yüksek hassasiyetli modelleme araçlarına eşi görülmemiş erişim sunmaktadır.

Başarılar ve Performans Göstergeleri

Boltz-1, sonuçları Google DeepMind’ın AlphaFold3'ü ile karşılaştırıldığında benzer seviyede doğruluk göstermesi açısından titizlikle değerlendirilmiştir. CASP15 gibi yerleşik veri setleriyle test edildiğinde, Boltz-1, kapalı kaynaklı bir AlphaFold3 çoğaltması olan Chai-1'i geride bıraktı. Önemli metrikler şunlardır:

• LDDT-PLI Doğruluğu: Boltz-1 %65, Chai-1'in %40'a karşı.
• Yerleştirme Kalitesi (DockQ > 0.23): Boltz-1 %83 puan alarak Chai-1'in %76'sını geride bıraktı.

Bu sonuçlar, Boltz-1'in protein-ligand ve protein-protein etkileşim modelleme gibi karmaşık görevler için güvenilirliğini vurgulamaktadır.

Küresel İşbirliği İçin Açık Bilim

Boltz-1'i farklı kılan özellik, açık kaynak erişilebilirliğidir. MIT lisansı altında yayınlanan paket, eğitim verileri, model ağırlıkları ve çıkarım kodunu içermektedir. Finansal ve teknolojik engelleri ortadan kaldırarak, Boltz-1 en güncel biyomoleküler modellemeye erişimi demokratikleştirmektedir.

MIT, bu aracı, şu alanlarda yenilikçi iş birliklerini hızlandıracak bir katalizör olarak görmektedir:

• İlaç Keşfi: Ligand-bağlanma tahminlerinde hassasiyeti artırmak.
• Yapısal Biyoloji: Protein yapılarına dair anlayışımızı ilerletmek.
• Sistem Biyolojisi: Karmaşık moleküler ağları modellemek.

Bir Ekip Çalışması

Bu başarı, MIT'deki çok disiplinli bir ekibin katkılarını yansıtırken, Genesis Therapeutics ve ABD Enerji Bakanlığı gibi işbirlikçiler tarafından desteklenmektedir. Ayrıca, bu girişim NSF Expeditions programı, DTRA DOMANE Tehdit programı ve Kanser Büyük Zorlukları kapsamındaki MATCHMAKERS projesinden sağlanan finansmandan da faydalanmaktadır.

İleriye Dönük

Boltz-1 ekibi, karmaşık biyomoleküler etkileşimleri modellemedeki yeteneklerini artırmak için sürekli iyileştirme taahhüdünde bulunmaktadır. Bu gelişmelerin önümüzdeki aylarda hayata geçmesi beklenmekte olup, Boltz-1'in biyomoleküler modellemede öncü konumunu korumasını sağlamaktadır.

Bugün Boltz-1'i Deneyin

Araştırmacılar, Boltz-1'e GitHub deposu üzerinden erişebilir, Slack üzerinden tartışmalara katılabilir veya teknik raporu okuyabilir.

Daha fazla detay için resmi duyuruya göz atın: MIT Jameel Klinik'in Boltz-1'i.