Boltz-1: 생체 분자 상호 작용 모델링의 오픈 소스 혁명

November 20, 2024

MIT 자미엘 클리닉은 생체 분자 복합체의 3D 구조 예측에서 AlphaFold3 수준의 정확도를 달성한 혁신적인 오픈 소스 생체 분자 모델인 _Boltz-1_을 공개했습니다. Boltz-1은 구조 생물학에서 중대한 도약을 나타내며, 연구자와 조직에 고정밀 모델링 도구에 대한 전례 없는 접근을 제공합니다.

성과 및 벤치마크

Boltz-1은 엄격하게 평가되었으며, 결과는 Google DeepMind의 AlphaFold3와 동등한 정확성을 보여줍니다. 기존 데이터 세트인 CASP15와 같은 데이터 세트에 대해 테스트할 때, Boltz-1은 클로즈드 소스 AlphaFold3 복제본인 Chai-1을 초월했습니다. 주요 지표는 다음과 같습니다:

  • LDDT-PLI 정확도: Boltz-1은 65%를 달성했으며, Chai-1은 40%입니다.
  • 도킹 품질 (DockQ > 0.23): Boltz-1은 83%의 점수를 기록하여 Chai-1의 76%를 초과했습니다.

이 결과는 단백질-리간드 및 단백질-단백질 상호 작용 모델링과 같은 복합 작업에 대한 Boltz-1의 신뢰성을 강조합니다.

글로벌 협업을 위한 오픈 사이언스

Boltz-1을 다른 모델과 차별화하는 것은 그 오픈 소스 접근성입니다. MIT 라이선스 하에 출시된 이 패키지는 훈련 데이터, 모델 가중치 및 추론 코드를 포함합니다. 재정적 및 기술적 장벽을 없애면서 Boltz-1은 최첨단 생체 분자 모델링에 대한 접근을 민주화합니다.

MIT는 이 도구를 협력적 혁신의 촉매제로 생각하며, 다음과 같은 분야의 연구를 가속화하고자 합니다:

  • 약물 발견: 리간드 결합 예측의 정확성을 향상시킵니다.
  • 구조 생물학: 단백질 구조에 대한 이해를 향상시킵니다.
  • 시스템 생물학: 복잡한 분자 네트워크를 모델링합니다.

팀의 노력

이 성과는 MIT의 다학제 팀의 기여를 반영하며, Genesis Therapeutics 및 미국 에너지부와 같은 협력자의 지원을 받았습니다. 이 이니셔티브는 NSF Expeditions 프로그램, DTRA DOMANE 위협 프로그램 및 Cancer Grand Challenges의 MATCHMAKERS 프로젝트의 자금 지원도 받고 있습니다.

앞으로의 계획

Boltz-1 팀은 생체 분자 상호 작용 모델링 능력을 향상시키기 위해 지속적인 개선에 전념하고 있으며, 이러한 향상된 업그레이드를 향후 몇 달 내에 배포할 예정입니다. 이러한 발전이 이루어질 것으로 예상되어, Boltz-1은 생체 분자 모델링의 최전선에 남아 있을 것입니다.

오늘 Boltz-1을 사용해 보세요

연구자들은 GitHub 리포지토리를 통해 Boltz-1에 접근하고, Slack에서 대화에 참여하거나 기술 보고서를 읽을 수 있습니다.

자세한 내용은 공식 발표를 방문하세요: MIT 자미엘 클리닉의 Boltz-1.

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