Boltz-1: ثورة مفتوحة المصدر في نمذجة التفاعلات الجزيئية الحيوية

قدمت عيادة MIT جميل Boltz-1، نموذج جزيئي مفتوح المصدر رائد يحقق دقة على مستوى AlphaFold3 في التنبؤ بالهياكل ثلاثية الأبعاد للمركبات الجزيئية الحيوية. يمثل Boltz-1 قفزة كبيرة إلى الأمام في علم الأحياء الهيكلي، حيث يوفر للباحثين والمنظمات وصولاً غير مسبوق إلى أدوات النمذجة عالية الدقة.

الإنجازات والمعايير

تم تقييم Boltz-1 بدقة، حيث أظهرت النتائج دقة مماثلة لدقة AlphaFold3 من Google DeepMind. عند اختباره ضد مجموعات بيانات معروفة مثل CASP15، تفوق Boltz-1 على المنافسين مثل Chai-1، وهو نسخ مغلق المصدر من AlphaFold3. تشمل المؤشرات الرئيسية:

• دقة LDDT-PLI: حقق Boltz-1 65% مقابل 40% لـ Chai-1.
• جودة التوصيل (DockQ > 0.23): حصل Boltz-1 على 83%، متجاوزاً 76% لـ Chai-1.

تسلط هذه النتائج الضوء على موثوقية Boltz-1 في المهام المعقدة مثل نمذجة تفاعلات البروتينات مع الجزيئات الصغيرة وتفاعلات البروتينات مع بعضها.

العلوم المفتوحة للتعاون العالمي

ما يميز Boltz-1 هو وصوله المفتوح المصدر. تم إصداره بموجب ترخيص MIT، وتتضمن الحزمة بيانات التدريب وأوزان النموذج وكود الاستدلال. من خلال القضاء على الحواجز المالية والتكنولوجية، ي democratizes Boltz-1 الوصول إلى نمذجة الجزيئات الحيوية الرائدة.

تتصور MIT أن تكون هذه الأداة حافزًا للابتكار التعاوني، مما يسرع البحث في مجالات مثل:

• اكتشاف الأدوية: تعزيز الدقة في التنبؤات المرتبطة بالروابط.
• علم الأحياء الهيكلي: تقدم فهمنا للهياكل البروتينية.
• علم الأحياء النظامي: نمذجة الشبكات الجزيئية المعقدة.

جهد جماعي

تجسد هذه الإنجاز مساهمات من فريق متعدد التخصصات في MIT، بدعم من متعاونين مثل Genesis Therapeutics ووزارة الطاقة الأمريكية. كما ينفذ المشروع بدعم من برنامج NSF Expeditions، وبرنامج تهديدات DTRA DOMANE، ومشروع MATCHMAKERS تحت تحديات السرطان الكبرى.

التطلع إلى الأمام

يلتزم فريق Boltz-1 بالتحسين المستمر، مع خطط لتحديثات إضافية لتعزيز قدراته في نمذجة التفاعلات الجزيئية الحيوية المعقدة. من المتوقع أن يتم طرح هذه التحسينات خلال الأشهر القادمة، مما يضمن بقاء Boltz-1 في طليعة نمذجة الجزيئات الحيوية.

جرب Boltz-1 اليوم

يمكن للباحثين الوصول إلى Boltz-1 من خلال مستودع GitHub، والانضمام إلى المناقشة على Slack، أو قراءة التقرير الفني.

للحصول على مزيد من التفاصيل، تفضل بزيارة الإعلان الرسمي: Boltz-1 من عيادة MIT جميل.