Boltz-1:生物分子相互作用建模的开源革命

November 20, 2024

MIT Jameel Clinic推出了_Boltz-1_,这是一个突破性的开源生物分子模型,能够在预测生物分子复杂体的3D结构方面达到AlphaFold3级别的准确性。Boltz-1代表了结构生物学的重要飞跃,为研究人员和组织提供了前所未有的高精度建模工具。

成就与基准

Boltz-1经过严格评估,结果表明其准确性与Google DeepMind的AlphaFold3相当。在与CASP15等既定数据集进行测试时,Boltz-1的表现优于如Chai-1等竞争对手,Chai-1是一个封闭源的AlphaFold3复刻。关键指标包括:

  • LDDT-PLI准确性: Boltz-1达到了65%,而Chai-1为40%。
  • 对接质量(DockQ > 0.23): Boltz-1得分83%,超过Chai-1的76%。

这些结果强调了Boltz-1在蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质相互作用建模等复杂任务中的可靠性。

全球协作的开放科学

Boltz-1的独特之处在于其开源可及性。该软件包在MIT许可证下发布,包括训练数据、模型权重和推理代码。通过消除财务和技术障碍,Boltz-1使得前沿的生物分子建模得以民主化。

MIT设想这个工具将成为协作创新的催化剂,加速在以下领域的研究:

  • 药物发现: 提高配体结合预测的精准度。
  • 结构生物学: 增进我们对蛋白质结构的理解。
  • 系统生物学: 建模复杂的分子网络。

团队合作的成果

这一成就反映了MIT多学科团队的贡献,得到了Genesis Therapeutics和美国能源部等合作伙伴的支持。该项目还得益于NSF Expeditions项目、DTRA DOMANE Threats项目和癌症重大挑战下MATCHMAKERS项目的资金支持。

展望未来

Boltz-1团队致力于持续改进,计划进行进一步升级以增强其在建模复杂生物分子相互作用方面的能力。这些进步预计将在未来几个月内推出,以确保Boltz-1保持在生物分子建模的前沿。

今天就试试Boltz-1

研究人员可以通过其GitHub仓库访问Boltz-1,加入Slack上的讨论,或阅读技术报告

欲了解更多细节,请访问官方公告:MIT Jameel Clinic的Boltz-1

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